上海海关的隶属海关包括:浦东海关, 浦东国际机场海关,吴淞(宝山)海关 , 浦江(龙吴)海关,外港海关, 洋山海关, 外高桥保税区海关 ,经济技术开发区海关, 奉贤海关,莘庄海关 ,嘉定海关 ,金山海关 , 青浦海关和松江海关。
上海海关是国家设在上海口岸的进出境监督管理机关,是中华人民共和国直属海关。主要任务是:按照《中华人民共和国海关法》和其他有关法律、法规,监管经上海口岸进出境的运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品,征收关税和其他税费,查缉走私并编制海关统计和办理其他海关业务。