一般不建议存储过久，最多24小时，否则容易变质。
酸度高的水果醋对于容器会具有侵蚀性，不能使用塑料或是金属的容器，唯一的选择就是能密封的玻璃瓶，使用前也必须清洗干净并充分的擦干，不论是容器还是水果，如果清洗后没有擦干都会破坏水果醋的纯度，甚至造成腐坏。 水果醋的保存期限很长，只要保存得当没有变质，大可安心的慢慢享用，除了要注意完全密封和避免渗入水之外，保存的场所也要注意防止阳光直接照射，通风良好的厨柜，甚至桌子、床底下，都是很好的保存场所。
