商住两用房买后是每年要交税的。根据《中华人民共和国房产税暂行条例》规定，商住房的产权人应该在每年4月份前向房屋所在地地税部门申报缴纳房产税，房产税实行的是比例税率，以房产原值(评估值)为计税依据，税率为1.2%，房产税年应纳税额=房产原值×(1-30%)×1.2%或税务机关评估值×1.2%。
对于房产税，个人普通非营业住房是不用交房产税的，如果是商业使用的，则要交房产税。房产税自1986年10月1日开始征收。对商业和写字楼以房产原值减除30%后的余值为税基，1.2%的税率，对住宅类免征。商住两用本质上是商业，所以有征税依据。
商住两用房出租时需要缴纳的税费：营业税：租金收入×5%城建税：营业税额×7％教育费附加：营业税额×3％堤围费：租金×0.18%房产税：租金×12％印花税：每份合同需按租赁金额的0.05%贴花个人所得税：(租金-税费-维修费800-法定扣除额800)×20％。
