债权转让协议债务人不同意的处理方式是通知即对债务人发生效力，不同意不影响债权转让的效力。根据合同性质或法律规定不得转让或当事人约定不得转让的情形外，债权人可以将债权转让给他人，且无须经债务人同意。但是债权转让必须要通知债务人。未经通知的，对债务人不发生效力。
【法律依据】
根据《民法总则》规定，合同一方将合同的权利、义务全部或部分转让给第三人的，应当取得合同另一方的同意，并不得牟利。依照法律规定应当由国家批准的合同，需经原批准机关批准。但是，法律另有规定或者原合同另有约定的除外。
