黑白2的时间点是口袋妖怪黑白的两年之后。玩家将以新的主人公进行游戏。初始城市由鹿子镇变为桧扇市。初始精灵由白露赠送。切莲是道馆馆主。反派组织中出现新头目。酋雷姆增加黑、白色酋雷姆。龙卷云、雷电云、土地云增加灵兽形态。冒险方面由于合众地图的变化，出现新城市和新道馆。口袋妖怪世界淘汰赛，能与口袋妖怪正篇系列的所有道馆馆主与冠军对战。新设施精灵坞，通过选择剧情来拍摄电影，根据选择的剧情展开各种对战，巨大化的精灵直接在战斗中出场。黑色城市与白色森林的居民系统取消，可以自由切换游戏中黑色城市或白色森林的出现。背包增加自由空间栏，可将常用的道具移动至自由空间栏存放。精灵菜单的携带道具菜单中增加移动项，可直接移动或交换精灵的携带道具。通关后可解锁助手模式或挑战模式，改变游戏中NPC的难度。潜入连接内增加集会任务系统，最多可以100人同时进行任务。总结：不管是哪方面，黑白2都更胜一筹。
