单独是形容词带有少许褒义，独自是副词本身并无褒贬，都可以做状语，但独自只能指认，单独既可指人，也可指物。单独还有不跟别的事物合在一起的意思，独自没有这个意思。侧重点不同，前一个在强调一个人；后一个在强调个人的强大能力。
