振动频率不同、特点不同、危害不同等。
1、振动频率不同
超声波是一种频率高于20000赫兹；次生波是频率小于20Hz(赫兹)。超声波因其频率下限大于人的听觉上限而得名。超声波的方向性好，穿透能力强，易于获得较集中的声能，在水中传播距离远，可用于测距、测速、清洗、焊接、碎石、杀菌消毒等。
2、特点不同
次声波的特点是来源广、传播远、能够绕过障碍物传得很远；超声波的特点是在传播时，方向性强，能量易于集中。
3、危害不同
次声波会干扰人的神经系统正常功能，危害人体健康；超声波对人有利。一定强度的次声波，能使人头晕、恶心、呕吐、丧失平衡感甚至精神沮丧。更强的次声波还能使人耳聋、昏迷、精神失常甚至死亡。
超声波是一种波动形式，它可以作为探测与负载信息的载体或媒介如B超等用作诊断；超声波同时又是一种能量形式，当其强度超过一定值时，它就可以通过与传播超声波的媒质的相互作用，去影响，改变以致破坏后者的状态，性质及结构用作治疗。
