肚子饿时，喝酸奶不好，因为空腹时胃内的酸度很大，此时乳酸菌易被胃酸杀死，保健作用被大大减弱，各种营养成分来不及消化吸收就被排出体外。饭后两小时左右是喝酸奶的最佳时间，此时酸奶中的各种营养物质更容易被吸收。
同时，酸奶尤其不能和抗菌素同时服用，比如氯霉素、红霉素等抗生素，还有磺胺类药物，它们都可能杀死或破坏酸奶中的乳酸菌，使之失去保健作用。
