主要区别在于：
后续审计是指在审计报告发出后相隔一定时间内，审计人员为检查被审计单位对审计发现和建议是否已经采取了适当的纠正行动并取得预期的效果的跟踪审计。通常出现在内控审计、效率和效果审计中，是对审计结果反馈和反应的继续审计。
复审是审计人员对原来的审计工作进行全部或部分的复查，以确定原来所做的审计结论的正确性。引起复审的原因可以归纳为以下三个方面：被审计单位对审计结论提出异议；审计机关对于审计小组的工作进行检查，为保证审计质量而进行复审；法律诉讼引起复审。通常出现在财务报表审计中，是对审计结果质量的控制。
