在使用前最好不要清洗虫草花，因为清洗时会使附在虫草花实体上具有食疗功效的真菌孢子粉流失，从而影响它原有的食用功效。但如果买散装的虫草花，经过很多人的接触，看上去不太干净，可先在使用前清洗下，所以放水里清洗泡泡就可以了，但是不要泡得太久。
虫草花的成分里面有氨基酸及其他营养物质，加热时间长了会破坏其成分，影响功效。虫草花煲汤时不宜长时间煲煮，以免香味散失、营养成份破坏，宜在汤将煲成前加入虫草花子实体，再以文火小火煲30分钟左右效果最佳。如果是虫草花炖汤，炖的时间最好要控制在2小时以内。
