关于双重劳动关系的争议的处理是:
1、停止办理职工停薪留职手续;
2、不得再为职工办理挂名手续;
3、解决好两不职工的劳动关系;
4、加强对学习、培训人员的管理;
5、彻底清理外出劳务人员;
6、取消外借,建立合理流动制度。
【法律依据】
根据《劳动合同法》第三条,订立劳动合同,应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。