一、杀菌保存：
1、先包装后杀菌，可将装入袋中或瓶中的醪糟置于80摄氏度的热水中30分钟杀菌。方法简单，容易操作。
2、在醪糟未包装前用瞬时灭菌器灭菌，在灭菌后立即进行包装。此法在灭菌和包装过程中可能造成二次污染，故对环境的要求较高，效果也不是特别好。
3、用紫外线灯管在包装的同时灭菌。此法在杀菌的时候，对原料的厚度要求较高，若厚度大，则杀菌效果不彻底，造成保质期短，但是此法简单可行，且代价低。
二、包装保存：
1、充气包装保存，醪糟属于黏稠状的液体，可以采用充气包装，只要冲入的气体能阻止甜酒曲的继续发酵即可。此法代价稍高，但商品的保质期可以大大延长。
2、真空包装保存，这种醪糟在杀菌时由于没有受到高温的作用，所以在口味和色泽上都很好的保留了新鲜醪糟的特点，效果较好。
三、冷冻保存：放入冰箱保存。
