有机大米不是转基因大米，有机大米和转基因大米是不同层次的概念。
1、有机主要指生产方式，而转基因更多在于育种方法上，有机大米使用的是常规水稻育种，常规水稻是通过系统选育、杂交育种、辐射育种和化学诱变等方法培育的纯系品种，目前中国种植的大米大部分品种均为常规水稻，常规水稻在整个研发过程中，从未涉及转基因技术；
2、转基因水稻是通过转基因方法培育的水稻品种，所谓转基因是将基因人工转移的一种技术，它将人工分离和修饰过的基因转移到生物体的基因组中，由于导入基因的表达，引起生物体性状可遗传的变异，利用这种变异培育新品种；
3、中国规定优质大米的生产分为无公害、绿色和有机三大类，三者的差别在于生产时所要求的土、水、气等环境条件和所用的化肥、农药等投入品不同，与使用品种无关，三者均需通过农委相关管理部门的认证，有机大米只是优质大米的一种，与转基因没有关系。
