同分异构体既可以是同种物质，也可以是不同种物质。
同分异构现象包括几种不同类型：碳架异构、构型异构、立体异构和构象异构。其中前三种同分异构体被认为是不同种物质，它们之间的化学、物理性质差距较大。而构象异构是由于同种分子中的sigma键在不同条件下，发生不同程度的旋转，导致其空间构象有差异。这种差异相对前三类对其化学、物理性质影响小得多。这类异构体通常认为仍是同种物质。
