酿醋的是醋酸菌。醋酸菌即醋酸杆菌，有两种类型的鞭毛：一群是周生鞭毛细菌，可以把醋酸进一步氧化成二氧化碳和水；另一群是极生鞭毛细菌，不能进一步氧化醋酸。两群都是革兰氏阴性杆菌。培养醋酸菌时，需要用含糖或酵母膏（维生素B）的培养基，在肉汤蛋白胨培养基上生长不良。大多数菌株可用六碳糖和甘油作为碳源，对甘露醇和葡萄糖酸盐很少能利用或不能利用，不分解乳糖、糊精和淀粉。
