南怀瑾已经修到了圣人的层次，峨眉山下来之后，南怀瑾又在自己一个弟子家闭关，披阅了《永乐大典》、《四库备要》等典籍，随后进入西藏。受到贡噶活佛、根桑活佛等当时名重一时大活佛的传承与认证，特别是贡嘎活佛后来还亲自去成都特地为南怀瑾传授了显密大小戒律，并书写了藏文传法传戒的证书交给了南怀瑾。这大活佛的认证书，即肯定和代表了南怀瑾是密宗上师的合法身份以及可以传法的资格。
四川高等法院首席检查官谢子厚还供养了南怀瑾红教、白教、黄教、花教等多种秘藏法本，更有说他的普传法门准提法是文殊菩萨亲传的。面见本尊，已经是大成就者的境界，一个大成就者必然具有六种神通，南怀瑾就他惊人的记忆力，预言能力以及教化能力，都说明了他具备无与伦比的神通和慈悲心。
南怀瑾堪称文化方面的“奇人异士”。南怀瑾精研儒、释、道，将中国文化各种思想融会贯通。除此之外，对于医学、卜算、天文、拳术、剑道、诗词等皆有专精，可谓是博学多才。显然南怀瑾已经修到了圣人的层次。
