两个学院各有千秋，专业的好坏取决于自身是否适合。1、清华大学经济管理学院的前身是清华大学经济系。清华大学经济管理学院成立于1984年，朱镕基教授担任首任院长。经过二十多年的发展，现已成为中国乃至亚洲地区最优秀的商学院之一。现任院长是经济学家钱颖一教授。2013年度中国最佳EMBA排名第一。2、清华大学自动化系成立于1970年。清华大学将一批有关的专业联合建立起国内第一个自动化系（初期名为工业自动化系），其人员主要来源于电机系和动力机械系两大部分。自动化系的一级学科为“控制。