石花菜颜色有紫红、 深红或绛紫色.在受多光的海区生长的往往呈淡黄色。新鲜的石花菜藻体色泽十分鲜艳。石花菜藻体直立丛生.羽状分枝.互生或对生.枝呈扁平或亚柱形。藻体分枝很多.主枝生侧枝.侧枝上生小枝.各种分枝的末端尖形。整个藻体上部分枝较密.下部分枝较稀疏。石花菜藻体的基本构造可分为两部分.即皮层和髓部。髓部由数十条平行纵列的长圆柱状细胞所构成。皮层最外面一层细胞排列紧密.表面被有厚膜.细胞内有色素体.是进行光合作用的场所。石花菜生长属于顶端生长.它的每一个分枝的顶端都有一个。