肽链之间通过肽键连接。多个氨基酸脱水缩合通过肽键相连接形成肽链。2个氨基酸脱去1分子水形成1个肽键。一条肽链由n分子氨基酸脱去n-1分子水形成n-1个肽键相互连接而成。而蛋白质则是由多条肽链经过氢键、二硫键、范德华力等作用通过二级、三级、四级空间结构折叠盘旋形成的复杂的结构。