办理《因公往来港澳通行证》流程为。1、领取、填写《内地居民往来港澳台地区申请表》。2、提交居民身份证、户口簿复印件，交验原件。3、在职、在学人员须提交所在单位对申请人前往港澳台的意见。4、非在职、在学人员须提交户口所在地公安派出所对申请人前往港澳台的意见。5、提交与赴港澳台申请事由相应的证明。