镁元素是构成叶绿素a的必需元素。色素可以吸收传递转化光能，这些都是和光反应息息相关的，由于光反应的降低进而影响暗反应，所以光合作用降低。缺镁直接影响的是光反应，由于叶绿素的不足而直接导致光反应的下降，光反应为暗反应提供ATP和NADPH，由于还原剂和能量的减少，影响了C3转变为有机物，所以，镁最终影响了光反应和暗反应，直接影响光反应。叶绿素a和b都可以吸收光能，但只有少数处于激发状态的叶绿素a可以将光能转化为电能。