秦汉建县，始分东阳、射阳、平安，后迭经动乱，南齐时并称安宜县，沿用至唐。“唐上元三年有一尼姑真如于境内获“八宝”，献于皇室。时逢“安史之乱”平息后，唐肃宗视为定国之宝，遂将土元三年改为宝应元年，同日将安宜县改称为宝应县。明朝时期，宝应县隶高邮州。清朝时期属扬州府。民国时期先后属淮扬道、淮阴行政督察区：建国初期则先后属苏北行政公署扬州、泰州专区。1953年1月，宝应隶属江苏省扬州专区。1983年3月，实行市管县体制，宝应县隶属扬州市。