脑组织的组成较多，各组成单位的ct值有所不同，主要有皮质和髓质，两者的密度有差异，脑皮质的ct值一般在30-40hu之间，脑髓质的ct值在28-32hu之间。脑内还有一些正常的生理性钙化的ct值则更高，可以高达几百。脑室里面主要是脑脊液，所以ct值在0-10hu之间。在相同的部位，成年人的ct值比儿童和老年略高。
