魂门穴具有疏肝理气，降逆和胃的功效。魂门穴主治肝、胃及局部疾患：如脘腹胀满，胸痛彻背，呕吐呃逆，饮食不下，胃脘疼痛，腹中雷鸣，小便黄赤，头痛头昏，黄疸，眩晕，胸胁痛，呕吐，背痛，泄泻，胁痛，胸胁胀痛，脊背疼痛，食不化，现代又多用魂门穴治疗肝炎，胆囊炎，胸膜炎，胃炎，肋间神经痛，神经衰弱，肝炎，胃痉挛，食道狭窄，消化不良，神经症，癔病，心内膜炎，肌肉风湿病等。
