辣椒的病虫害主要有病毒病、疫病、灰霉病、炭疽病、立枯病、菌核病、朱砂螨、白粉虱、蚜虫、烟青虫和地下虫蝼蛄，蛴螬等。防治原则:应坚持预防为主，综合防治的方针，应以农业防治、物理防治、生物防治为主，化学防治为辅。农业防治:选用抗病品种，培育适龄壮苗，调控好棚室内温、湿度及水、肥、光照等条件，改进耕作制度与非茄果类作物轮作，避免连作等。
疫病和疽病可用退菌特1000倍+喜逢春60kg7jc/包防治;褐斑病可用退菌特1000倍+喜逢春或诺尔毒克比久防治。黄瓜花叶病毒主要靠蚜虫传播，也可机械传毒。烟草花叶病毒毒力强，传播方式广。尤其是重茬地如再施人含有病残体的粪肥，发病早且严重。
至于黄瓜花叶病毒，则是在气温高、干旱的年份有蚜虫猖獗时才发病重。防治方法，首先要及时防蚜虫。定植前先打一次防治蚜虫剂，定植后还要及时防蚜。其次加强定植后的管理。应适当增加中耕次数和深度，最好不打脚叶。本着前期促秧发根、中期促秧攻果、后期保秧防衰的原则，综合运用农业栽培措施。
棉铃虫、烟青虫用速打、绿高等;蚜虫、蓟马用艾美乐10000倍液、乐氯乳油1200 ~ 2000倍液。
