1、出苗后要控水，床内湿度过大可以撒草木灰、细土调节。浇水要根据土壤而定，见干见湿。床土不发白不浇水，浇水应在晴天中午进行，浇后通风排湿，小水浇，晾晒1天，大水浇，至少晾晒2天，防止湿度大引起猝倒病、立枯病。晾晒好后，在把薄膜盖好。
2、苗子4叶期后，若苗床缺水，应及时浇水，促进根系发育，以利定植后加速缓苗。浇水应在10—13点之间进行；整个成苗期，要保持床土温润，保持秧苗良好生长。
3、栽前7—10天断水炼苗，定植前1天苗床浇一次透水。
4、温度。整体温度控制要前高后低，白天保持23-25℃，夜间13-15℃，寒冷天气要注意保温防冻。要加强通风晴天或阴雨雪天，大棚内的小拱棚薄膜应揭开，以增加透光，增强秧苗抗性。随着秧苗的长大，对低温的适应能力逐渐增强，这一点有别于番茄和茄子。因此，温度的管理应是呈缓慢下降。
5、移栽。移栽辣椒前，一定要注意除草剂的选择，残留期过长的不宜选择，以防影响辣椒苗缓苗发根；移栽时，辣椒苗要离条施的底肥一定距离，防止辣椒烧苗，死苗。
6、追肥。辣椒苗期一般进行叶面追肥，从第4片真叶展开期开始，隔7—10天施一次艾护辣椒专用植物疫苗500-800倍液。晴天盖膜前喷施效果较为理想。叶子发黄，苗床底肥不足时，可在6、8、12叶期用尿素追施。每床150—200克，施后浇一次小水。
