种皮的颜色由花青素类物质的沉积决定。种子最重要的功能就是传宗接代，它里面有幼小的胚。胚是幼小的植物体，而种子其他部分的作用就是要匡扶幼主，待其成才。种子中胚乳负责给幼主提供营养，而种皮呢，就是神武大将军，负责守卫幼主安全。一颗种子所面临的外部考验有很多，包括被吃了，被挤碎了，被烧了。那么种皮上的那些事儿，无非就是为了防止种子内部的胚和胚乳遭受这些厄运。很多植物的种皮是黑色的，还有很多植物的种皮是白色的，还有很多植物的种皮是黄色的。
