1、科属不同。凤仙花是凤仙花科属一年生草本花卉，它高60-100厘米，茎粗壮，肉质，直立，还有急性子、女儿花、指甲花等名称；而水梅花是竹桃科、倒吊笔属，是属于灌木类的一种花，茎细而脆，一碰就断，但很容易成活，常常作为绿篱植物或者盆栽栽种。
2、叶子不同。它们二者形态特征也有所不同，最明显的就表现在叶片上，水梅花的叶片呈披针形，叶片边缘为波浪形，颜色也比较浅，呈草绿色。而凤仙花和前者形状不一样，叶片偏长一点，除了披针形外，还有倒披针形、狭椭圆形，边缘也不是波浪形，而是锐锯齿，叶片颜色也比较深，呈深绿色。
3、花期不同。它们花朵虽然比较相似，但是花期却是不一样的，水梅花的花期很长，能够从春季一直开放到秋季，延续时间很长。而凤仙花的花期主要集中在夏季，一般情况时7月开放，到了10月份就会逐渐凋零，所以被水梅花开花时间要晚一点。
4、花朵不同。水梅花的花朵颜色主要是粉白色的，花瓣也比较多，有多层；而凤仙花的花色比较丰富，有白色、粉红色以及紫色等，花朵也分为单瓣和重瓣之分。但是不管花瓣的数量是单瓣还是重瓣，都没有水梅花的花瓣多。
