1、本质不同。股本溢价是指股份有限公司溢价发行股票时实际收到的款项超过股票面值总额的数额。资本溢价是指企业在筹集资金的过程中，投资人的投入资本超过其注册资金的数额。
2、所属不同。股本股本溢价是资本公积一种，而资本公积是指投资者或者他人投入到企业、所有权归属于投资者，并且投入金额超过法定资本部分的资金。资本公积包括：资本（或股本）溢价、接受捐赠非现金资产准备、股权投资准备、拨款转入、外币资本折算差额、关联交易差价以及其他资本公积。资本溢价版是有限责任公司投资者交付的出资额大于按合同、协议所规定的出资比例计算的部分。
