由于沉箱作业条件差，对人员健康有害，且工效低、费用大，加上人体不能承受过大气压，沉箱入水深度一般控制在35米以内，使基础埋深受到限制。因此，沉箱基础除遇到特殊情况外，一般较少采用，具体适用于如下4种情况：
待建基础的土层中有障碍物而用沉井无法下沉，基桩无法穿透时；待建基础邻近有埋置较浅的建筑物基础，要求保证其地基的稳定和建筑物的安全时；待建基础的土层不稳定，无法下沉井或挖槽沉埋水底隧道箱体时；地质情况复杂，要求直接检验并对地基进行处理时。
