1、肯尼迪的死有两种说法，一种是肯尼迪和美国的黑手党有恩怨。不管谁对谁错，肯尼迪是被黑手党害死的。因为依靠美国的保密条例，这件事将会在被刺杀的一百年后的2063年公布；在美国第一种观点基本形成主流；
2、另一种说法是被中央情报局暗杀。这是源于一本《外星人的秘密》的书中提到，说美国中央情报局，参与关于以”J11小组“为中心的11人组成的和外星智慧生命体达成协议。用地球人的人和动物做生物试验，用于研究对外星人来说的史前智慧生命形式的研究。而美国人能得到是外星科技。而肯尼迪总统要将此事公诸于世，被杀人灭口。这种说法没有证据来证明它的真实性。
