九尾入侵木叶是在《火影忍者》的第468集和第469集，虽然九尾是一切故事的开端，但直到鸣人的妈妈出现，向他说起16年前的往事，这一场景才真正完全呈现在观众面前，鸣人的父亲就是因九尾而死，鸣人的命运也因九尾而改变。
上古时期，有一颗神树，它的查克拉被夺走之后，便幻化成了破坏力极强的十尾，为了阻止十尾继续作恶，六道仙人将它封印，并将十尾的查克拉分为九份，成为九只尾兽，九尾就是其中之一，也是最厉害的一只尾兽。
六道仙人死后，九尾破坏了很多村庄，使众人流离失所，后来它被宇智波斑收服，初代火影的妻子漩涡水户把九尾封印在了自己体内，她死后，九尾又被封印在了漩涡玖辛奈体内，但在漩涡玖辛奈分娩时，一个神秘的面具男打开封印放出了九尾。
这个面具男就是宇智波带土，他将九尾放出，就是希望九尾继续危害人间，以便达成自己不可告人的目的，那时火影已经传给了波风水门，他是第四代火影，也是鸣人的父亲，他将九尾封印在了鸣人体内，自己却因使用尸鬼封尽而牺牲。
鸣人小小年纪便失去父母，还因为体内被封印了九尾而遭众人嫌弃，在成长过程中，鸣人有好几次都因控制不住九尾的力量而兽化，他和九尾也一直处于敌对状态，但随着时间的推移，他们在相处过程中逐渐理解了对方。
最终鸣人和九尾成为好朋友，在九尾的帮助下，鸣人成为完美人柱力，在与佐助的决战中，九尾将所有的查克拉都给了鸣人，从此陷入沉睡，不过在剧场版中，九尾不仅成功苏醒，还恢复了从前的力量。
