支付宝密钥和商户ID就是支付宝数字证书的加密码，为了保证安全而设置的。举个浅显的例子，支付宝数字证书就是一把锁，支付宝证书密匙就是这把锁的锁匙，它的作用就是为了防止数字证书被非支付宝账户拥有人导出导入使用。
