饲养一只仓鼠，放在笼子里的垫料也重要，这些垫料可以用丝制品，可以用棉花。现在纸制品垫料、木屑最常用，因为取材方便，好清洁、更换。这些木屑一定要注意其气味不要浓重，比如含油脂较多的木屑不合适，这些气味会引起仓鼠不适，会导致仓鼠中毒。因此垫料的选择有多种，木屑较合适。
其它可以用干草、棉絮，甚至膨润土都可以作为仓鼠的垫料。但不管用哪种垫料，定期清洁较重要。同时这些垫料也要避免潮湿，尤其在南方，潮湿垫料会增加仓鼠感染皮肤病的风险。
