药用的黄酒跟烹饪的黄酒一样的。
黄酒是医药上很重要的辅料或“药引子”。中药处方中常用黄酒浸泡、烧煮、蒸炙一些中草药或调制药丸及各种药酒，据统计有70多种药酒需用黄酒作酒基配制。
黄酒的另一功能是调料。黄酒酒精含量适中，味香浓郁，富含氨基酸等呈味物质，人们都喜欢用黄酒作佐料，在烹制荤菜时，特别是羊肉、鲜鱼时加入少许，不仅可以去腥膻还能增加鲜美的风味。
黄酒虽然含酒精度较低，但其中还是含有微量的甲醇、醛、醚等有机化合物，对人体有一定的危害。而醛、醚等有机物的沸点较低，在20℃~35℃即汽化，甲醇的沸点也不过64℃左右，所以要将黄酒隔水烫热至70℃左右再喝，上述有害物质就会随温度升高而挥发掉。
而且酒中的酯类芬香物质也会随温度升高而挥发，使酒味更加芳香浓郁。因此，冬季饮用黄酒最好是将盛酒器放在水中烫热或隔火加温，但加热时间不宜过久，否则酒精挥发后淡而无味。黄酒虽然酒精度数低，但饮用时也要适量，不要空腹饮酒，更不要与碳酸类饮料同喝。
