1、概念不同，硕士是所有硕士的统称， 是一个介于学士及博士之间的研究生学位，通常象征具有对其专注、所研究领域的基础的独立的思考能力。工程硕士,指参加全国在职研究生统一招考，经过在职学习,取得工程硕士学位，没有研究生毕业证书，属于专业学位。
2、考试时间不同，硕士的招生考试是年初的统考，被录取后获得研究生学籍。毕业时，若课程学习和论文答辩符合学位条例规定，可获毕业证书和学位证书。 工程硕士全日制是参加1月份全国硕士统一统考，非全日制是指参加10月举办的在职研究生统一招考。
3、教育体系不同，工程硕士非全日制侧重于学术实践工程硕士全日制侧重于学术理论与实践。硕士侧重于学术理论与应用。
4、工程硕士全日制和硕士属于统一教育体系,只是类型不同，而工程硕士非全日制属于不同教育体系。
