1、地形特点：
玉门地貌分为祁连山地、走廊平原和马鬃山地三部分。绿洲215.6万亩，戈壁855.9万亩，山地689.4万亩，荒地238万亩。境内有南靠祁连山的前山，呈西北至东南走向，海拔2500米－3500米。境内最高峰妖魔山，海拔4585米。山麓平原区海拔自山前2500米降至1200米以下，相对高度110米－290米。中部有宽台山、黑山和低山丘陵，分隔赤金、花海两地。北部有马鬃山，呈西北至东南走向，山势低矮，坡度平缓，海拔1400米－1700米。西部的玉门镇片区位于昌马河冲积扇地带，扇腰以上为戈壁，以下为绿洲，绿洲外系扇原平原，地势自东南向西北倾斜。
2、气候特点：
玉门属大陆性中温带干旱气候，降水少，蒸发大，日照长，年平均气温6.9℃。1月最冷，极端最低可达零下28.7℃；7月份最热，极端最高达36.7℃。年日照时数3166.3小时，平均无霜期为135天。年平均降水量为63.3毫米，蒸发量达2952毫米。年平均风速为4.2米/秒。
3、水资源特点：
截至2009年，玉门地表年径流量合计为10.915亿立方米，疏勒河、白杨河、石油河、小昌马河年径流量12亿立方米 ，全市地下水综合补给量平水年为5.77亿立方米，中等干旱年为5.23亿立方米。先后建成中型水库1座，小型水库3座，小塘坝129座，库容水量达127万立方米。
