有害微生物对人类最重要的影响之一是导致传染病的流行，有些腐败性微生物会引起食品气味和组织结构发生不良变化，能够造成食品、布匹、皮革等发霉腐烂。
微生物是包括细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生动物等在内的一大类生物群体。如大肠埃希式菌，白假丝酵母菌，嗜肺军团菌，金黄色葡萄球菌等。
1、肠埃希氏菌通常被称为大肠杆菌，于20世纪中叶，人们认识到一些特殊血清型的大肠杆菌对人和动物有病原性，尤其对婴儿和幼畜，常引起严重腹泻和败血症；
2、白假丝酵母菌是一种真菌，通常存在于正常人口腔，上呼吸道，当机体免疫功能或一般防御力下降或正常菌群相互制约作用失调，则本菌大量繁殖并改变生长形式侵入细胞引起疾病；
3、嗜肺军团菌是一种有鞭毛，革兰氏阴性，军团菌属多形态性的短小球杆菌。会引起急性发热性呼吸道疾病，现已提出了超过30种军团杆菌，至少19种是人类肺炎的病原。
