公司账户被冻结的原因：
1、法院检察院冻结(民事诉讼中，法院依法地方裁定冻结);
2、政府相关机构或司法机关的冻结(单位因涉嫌犯罪);
3、公司存在和银行的财务纠纷(银行向法院申请冻结);
公司账户冻结一般是要经过法院的保全手续才能冻结公司账户，冻结后钱是只能进不能出，除非法院给解冻。
【法律依据】
《民事诉讼法》第二百四十四条，被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权查封、扣押、冻结、拍卖、变卖被执行人应当履行义务部分的财产。但应当保留被执行人及其所扶养家属的生活必需品。采取前款措施，人民法院应当作出裁定。
