1、在低负荷工况下，会产生相当大量的NOx（氮氧化物）与高温，这样对于三元催化器的要求会很高。
2、缸内直喷技术对于一些硬件设施也要求很高，例如需要配备高压喷油嘴，以提高油气的雾化程度与混合效率；缸内直喷系统的发动机除了在材质上更加讲究，而且为了分层燃烧时控制气体的流向，就连活塞、燃烧室形状也都需要特别设计；最最重要的一点，缸内直喷需要稳定品质的高标号燃油。
3、缸内直喷由于不能像进气歧管喷射一样通过汽油对气门背部进行冲刷，时间长后会导致发动机积碳严重，气门背部留有厚厚一层积碳，影响ECU对进气量的判断，严重时可导致启动困难。
